Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC35C1Q96A29 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35C1Q96A29 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms