Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTSSAQ969W0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTSSAQ969W0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms