Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCE1Q969G3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCE1Q969G3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms