Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL2Q92772 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL2Q92772 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms