Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
AP3S1Q92572 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms