Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC3Q92529 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC3Q92529 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC3Q92529 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC3Q92529 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHC3Q92529 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHC3Q92529 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms