Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL1Q8WXF7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL1Q8WXF7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms