Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHIPQ8WWQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHIPQ8WWQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHIPQ8WWQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PHIPQ8WWQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHIPQ8WWQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHIPQ8WWQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHIPQ8WWQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms