Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L4Q8TEY5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L4Q8TEY5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L4Q8TEY5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L4Q8TEY5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L4Q8TEY5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L4Q8TEY5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L4Q8TEY5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L4Q8TEY5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L4Q8TEY5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L4Q8TEY5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms