Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF217Q8TC41 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms