Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37AQ8NEZ2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37AQ8NEZ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms