Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM3Q8NE01 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNNM3Q8NE01 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNNM3Q8NE01 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms