Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL23Q8NBE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL23Q8NBE8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms