Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00337Q8N6G1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00337Q8N6G1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms