Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4F7

RNF175, RING finger protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF175Q8N4F7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF175Q8N4F7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF175Q8N4F7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms