Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLGN4XQ8N0W4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms