Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC105Q8IYK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC105Q8IYK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC105Q8IYK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms