Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIMKLAQ8IXN7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMKLAQ8IXN7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms