Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWA5

SLC44A2, Choline transporter-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A2Q8IWA5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC44A2Q8IWA5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC44A2Q8IWA5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms