Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
NPM2Q86SE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NPM2Q86SE8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NPM2Q86SE8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NPM2Q86SE8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms