Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX20Q7Z614 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms