Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC29A4Q7RTT9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms