Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX7Q7RTT5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX7Q7RTT5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms