Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRADAQ7RTN6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADAQ7RTN6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms