Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTOP1Q7RTM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP1Q7RTM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP1Q7RTM1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms