Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPCAT2Q7L5N7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPCAT2Q7L5N7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LPCAT2Q7L5N7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT2Q7L5N7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms