Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SV2BQ7L1I2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms