Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUFY3Q7L099 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY3Q7L099 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY3Q7L099 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY3Q7L099 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms