Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM43BQ6ZT52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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