Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYHR1Q6ZMK1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYHR1Q6ZMK1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms