Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00114Q6XXX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms