Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUSD1Q6UWL2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms