Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC174Q6PII3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC174Q6PII3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC174Q6PII3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms