Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGMBQ6NW40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGMBQ6NW40 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGMBQ6NW40 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms