Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM68Q6AZZ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM68Q6AZZ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms