Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB3L3Q68CJ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms