Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E4F1Q66K89 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms