Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP1BQ659C4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP1BQ659C4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms