Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF3Q5VWG9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms