Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GFI1BQ5VTD9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFI1BQ5VTD9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms