Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRTP1Q5TC63 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms