Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM20Q5T481 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM20Q5T481 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM20Q5T481 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms