Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHYHD1Q5SRE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms