Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY4Q4G0A6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms