Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q499Y3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q499Y3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q499Y3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q499Y3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q499Y3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q499Y3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q499Y3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q499Y3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q499Y3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q499Y3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q499Y3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q499Y3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q499Y3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q499Y3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q499Y3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q499Y3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q499Y3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q499Y3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q499Y3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q499Y3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q499Y3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q499Y3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms