Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TYSND1Q2T9J0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TYSND1Q2T9J0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms