Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISXQ2M1V0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ISXQ2M1V0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISXQ2M1V0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms