Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTL8BQ17RB0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTL8BQ17RB0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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