Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMPG1Q17R60 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IMPG1Q17R60 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms