Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN21Q16825 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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